于长永，男，1981年2月，博士研究生，副教授，硕士生导师。
联系方式
电子邮件：cyyneu@126.com
研究方向
1) 生物信息数据高效存储与分析技术
2) 深度学习+AI赋能蛋白质组学研究技术
教育背景
2004.09-2009.07 东北大学计算机软件与理论 工学博士
2000.09-2004.07 东北大学信息与计算科学 理学学士
工作履历
2012.07-至今 东北大学秦皇岛分校计算机科学与技术专业 副教授
2009.07-2012.07 东北大学秦皇岛分校计算机科学与技术专业 讲师
2011.08-2013.08 中国人民解放军军事医学科学院 博士后
学术兼职
国际期刊《BMC Bioinformatics》,《Journal of Supercomputing》,《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》等审稿人。
科研情况
现主持重点项目子课题1项。曾主持中央高校基本科研业务费，主持国家自然科学基金青年基金，博士后基金各1项。主持东北大学秦皇岛分校校内科技支撑项目1项。曾作为主要研发人员参加科技部重点研发项目1项，参加国家自然科学基金课题 5项，辽宁省自然科学基金和河北省自然科学基金项目各1项。参加秦皇岛市科技计划项目1项。以第一作者在SCI期刊《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》、《IEEE Transactions on Big Data》、《BMC Bioinformatics》、《Neurocomputing》、《Journal of Supercomputing》发表论文多篇。共发表论文40余篇，SCI检索10余篇，EI检索30余篇。发明专利1项。获秦皇岛市科学技术进步奖(二等奖)1次。参编教材1部。
学术成果
【代表性学术论文】
[1].Changyong Yu, Xuxian Zhou, Xinyao Chen, Haitao Ma, Yuhai Zhao. gShapeLnoc: A Graph Network Incorporating Shapelet Embedding Model for LncRNA Subcellular Localization. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2025.
[2].Changyong Yu, Dekuan Gao, Xu Guo, Haitao Ma, Yuhai Zhao Guoren Wang. dwMLCS: An Efficient MLCS Algorithm based on Dynamic and Weighted Directed Acyclic Graph. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2024. DOI: 10.1109/TCBB.2024.3431558.
[3].Changyong Yu, Yuhai Zhao, Chu Zhao, Jianyu Jin, Keming Mao, Guoren Wang. MiniDBG: a novel and minimal De Bruijn graph for Read Mapping. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023. DOI: 10.1109/TCBB.2023.3340251.
[4].Yu Changyong, Ren Tianmei, Wenyu Li, Liu Huimin, Ma Haitao and Zhao Yuhai. BL: An Efficient Index for Reachability Queries on Large Graphs, IEEE Transactions on Big Data, 2023.
[5].Yu Changyong, Liu Huimin, Fazal Wahab, Ling Zihan, Ren Tianmei, Ma Haitao and Zhao Yuhai. Global Triangle Estimation Based on First Edge Sampling in Large Graph Streams, Journal of Supercomputing. 79(13): 14079-14116 (2023).
[6].Changyong Yu, Pengxi Lin, Yuhai Zhao, Tianmei Ren, Guoren Wang: A fast and efficient path elimination algorithm for large-scale multiple common longest sequence problems. BMC Bioinform. 23(1): 366 (2022).
[7].于长永， 李俊杰， 马海涛， 赵宇海. 一种针对大规模Read Mapping的高效DBG索引方法[J]. 东北大学学报（自然科学版）, 2023, 44(6): 770-776.
[8].Changyong Yu, Peng Liu, Yudi Liu, Haitao Ma, Yuhai Zhao. A Practical Stream data Cleaning Method based on Local Shape Feature. 2022 (Hangzhou), Asia Conference on Algorithms, Computing and Machine Learning.
[9].Yu Changyong, Zhao Yuhai, Zhao Chu, Ma Haitao and Wang Guoren. DiagAF: A More Accurate and Efficient Pre-Alignment Filter for Sequence Alignment. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, doi: 10.1109/TCBB.2021.3127879.
[10].Yu Changyong, Mao Keming, Zhao Yuhai, Chang Cheng, Wang Guoren. StLiter: A Novel Algorithm to Iteratively Build the Compacted de Bruijn Graph from Many Complete Genomes. IEEE/ACMTransactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2021, Feb 14. doi: 10.1109/TCBB.2021.3062068.
[11].Changyong Yu, Xin Qi, Haitao Ma, Xin He, Cuirong Wang, Yuhai Zhao. LLR: Learning learning rates by LSTM for training neural networks[J]. Neurocomputing, 2020, 394.
[12].Changyong Yu, Xin He, Haitao Ma, Xin Qi, Jiarui Lu, Yuhai Zhao. S-DenseNet: A DenseNet Compression Model Based on Convolution Grouping Strategy Using Skyline Method[J]. ACCESS, 2019, 183604.
[13].于长永，金建宇，刘鹏，赵宇海. 基于最小边集的De Bruijn图定位算法[J]. 东北大学学报, 2022,43(2)，153-159.
[14].于长永，王文涵，温秀静，赵宇海. 基于动态双重前缀的模糊相似性连接算法[J]. 东北大学学报，2022,43(3).
[15].马海涛， 路家蕊， 于文鑫， 于长永. 线性区域数量与PLNN表达能力的相关性[J]. 东北大学学报, 2021, 42(2): 201-207.
[16].于长永，何鑫，祁欣，马海涛. GMSDenseNet基于组多结构卷积的轻量级DenseNet [J]. 东北大学学报，2020,41(1)，12-16.
[17].于长永，李淼淼，赵楚，马海涛. 一种新颖的编辑距离限制下的相似性确认算法[J]. 东北大学学报，2019,40(11)，.1543-1548.
[18].于长永，高明, 柏禄一, 赵宇海. 一种带有长度和位置约束的字符串索引方法[J]. 东北大学学报，2018,39(7)，959-963.
【专利】
于长永; 赵楚 ; 一种基于位运算和SIMD并行操作的字符串过滤方法, 2024-8-2, 中国, ZL 2020 1 0876431.X
讲授课程情况
现讲授计算机科学与技术专业《计算机数学基础》和《群智能优化技术》课程。曾经讲授计算机专业《知识发现与数据挖掘》、《数值分析》、《最优化导论》、《并行计算》和《离散数学》等课程。
指导研究生情况
从2013年指导计算机专业研究生，目前指导研一、二、三学生各3人，已指导毕业研究生20余人。
